Offre de these en bioinformatique structurale et science des donnees

Offre de these en bioinformatique structurale et science des donneesCDD·Thèse·36 moisBac+5 / MasterLaboratoire de Physique et Chimie Théoriques·Vandoeuvre-lès-Nancy (France)1600 eurosDate de prise de poste : 1 octobre 2024 bioinformatique structurale science des données Chers collegues,Voici une offre de these dans le domaine de la bioinformatique structurale etde la science des donnees.Cordialement,Therese MalliavinLaboratoire de Physique et Chimie ThéoriquesUniversité de LorraineAnalyse de l'espace des conformations pour les protéines intrinsèquement désordonnéesCette thèse est financée par l'Initiative Lorraine Université d'Excellence (LUE),et se déroulera à l'Université de Lorraine, sous la direction de Thérèse Malliavin([email protected]), en collaboration avec Jérôme Idier (Laboratoiredes Sciences du Numeriques de Nantes, [email protected]) et Jung-Hsin Lin(Academia Sinica, [email protected]). Le financement est acquis.Le projet de thèse vise à développer des approches numériques pour améliorer l'analysede l'espace conformationnel de protéines intrinsèquement désordonnées. Ces approchesseront développées dans le cadre d'une méthode d'énumération discrète de conformationsde protéines l'approche Interval Branch-and-Prune (iBP), développée par Thérèse Malliavinà l'Université de Lorraine. Des méthodes issues de la théorie du transport optimal,basées sur l'utilisation de la distance de Wasserstein, seront appliquées pour concevoirune approche de clustering pour décrire l'espace conformationnel. Les approches numériquesdéveloppées seront testées sur deux protéines désordonnées étudiées expérimentalement àAcademia Sinica, Taiwan.Profil recherche:Étudiant de niveau Master ou équivalent, avec une bonne formation en science des données.De bonnes compétences en programmation sont recherchés avec un fort intérêt pour lesapplications à des systèmes biologiques.Le doctorant devra effectuer deux séjours de 6 mois à Taiwan pour développer la collaborationdans le cadre du programme pilote TIGP-X, initié en 2023 par Academia Sinica, et qui fournirales financements permettant la prise en charge du voyage et du séjour. Procédure : Envoyer un mail Date limite : 31 juillet 2024Offre publiée le 15 février 2024, affichage jusqu'au 31 juillet 2024 #J-18808-Ljbffr