INGENIEUR DE RECHERCHE EN GESTION DE BASE DE DONNÉES

CDD·IR·6 mois (renouvelable) Bac+5 / Master Hôpital universitaire Robert Debré · Paris (France) Statut ingénieur de recherche, échelon négociableInovAND, centre d’excellence dans le domaine des troubles du neuro-développement, réunit en Île-de-France des équipes cliniques et scientifiques ainsi que les associations de familles et de patients, afin d’assurer un meilleur continuum entre expertise diagnostique et thérapeutique, de développer la recherche appliquée en santé et fondamentale, et de renforcer la formation universitaire sur les troubles du neuro-développement. Ce centre, coordonné par le Pr Richard Delorme (Service de psychiatrie de l’enfant et de l’adolescent, hôpital Robert-Debré, AP-HP), s’intègre plus globalement dans la dynamique de l’Institut Robert Debré du Cerveau de l’Enfant.Au centre des recherches cliniques de InovAND figurent les explorations par imagerie cérébrale des patients, réalisées à l’Hôpital Robert-Debré au niveau du scanner d’Imagerie par Résonance Magnétique (IRM) à 3T et de la plateforme d’électroencéphalographie à haute résolution (EEG-HR). L’ingénieur de recherche travaillera à développer les ressources pour aligner l’ensemble de ses données et les rendre utilisables par l’ensemble de la communauté de chercheurs.Emploi typeInformatique, statistiques et calcul scientifiqueL’ingénieur de recherche sera en charge de la collecte des données brutes multimodales : imagerie par résonance magnétique (IRM), électroencéphalographie à haute résolution (EEG-HR) et basse résolution (EEG-LR), puces ADN, données cliniques, dans le cadre de la recherche sur les troubles du neuro-développement.Collecter ces données pour les unités du service de pédopsychiatrie sur l’espace de stockage NAS mis en place au sein de l’hôpital, en améliorant les procédures de collecte déjà en place avec les différents techniciens.Poursuite du travail de prétraitement des données multimodales, notamment d’anonymisation des données mises en place afin d’identifier chaque sujet par un master code unique. Conservation sécurisée de la correspondance sur serveur interne.Organisation de la base de données et mise à disposition des données uniformisées pour analyses.Réalisation d’une interface utilisateur déployable permettant d’accéder à l’ensemble des examens réalisés par chaque sujet de manière centralisée, ainsi que d’un outil de recherche (SQL, MySQL).Suivi ponctuel des différents protocoles de recherche pour lesquels l’hôpital est centre d’inclusion, acquisition des données, formatage et livraison au PI selon les exigences de chaque projet.Activités principalesS’assurer de la bonne collecte des données dans chaque service selon la méthode et le logiciel spécifique.Mettre en place et maintenir des bases de données anonymisées d’imagerie clinique et automatiser le flux de données pour une visualisation et une utilisation optimale des images IRM et des enregistrements EEG.Activités associéesOrganiser/Participer à la maintenance et à l’évolution de l’environnement informatique du laboratoire.Participer activement à la valorisation scientifique des projets de recherche.Participer à la vie de laboratoire.Expertise avancée en gestion de données et programmation informatique (environnement UNIX, Python, Matlab, shell scripting, SQL).Expertise avancée en traitement d’images biomédicales.Connaissances en IRM cérébrales et EEG.Maîtrise de l’anglais souhaitable.Savoir-faireSavoir organiser une base de données.Savoir manipuler des images IRM et des enregistrements EEG-HR et EEG-LR.Savoir adapter et développer des pipelines de traitements et d’analyses de données en vue de leur utilisation pour la population pédiatrique.Savoir faire le lien vers des utilisateurs non-experts.Savoir gérer les priorités et les contraintes.Savoir interagir avec des personnes de multiples expertises (cliniciens, chercheurs, informaticiens).Aptitudes organisationnelles.Autonomie, dynamisme, rigueur.Capacité à organiser/animer un groupe de support.Pédagogie.Capacité à rendre compte.Bon relationnel.Spécificité(s)/Contraintes du posteVeiller à la gestion, cohérence et exhaustivité des banques de données IRM et EEG avec les données cliniques recueillies sur un logiciel hébergé par le serveur de l’hôpital.Faire le lien le cas échéant avec les techniciens et cliniciens impliqués dans le recueil des données.Réaliser des déplacements sur différents laboratoires en Ile de France (Institut Pasteur, NeuroSpin CEA Saclay, …) de manière ponctuelle.Respect de la confidentialité des informations.Expériences souhaitéesExpérience en imagerie biomédicale.Expérience confirmée en gestion de base de données, et/ou en développement et évaluation d’outils de traitement et d’analyse d’images.Diplôme(s) souhaité(s)École d’ingénieur, Master 2 (BAC+5).Doctorat en physique / imagerie médicale / traitement d’images.Structure d’accueilCode unitéCentre d’excellence InoVANDLe centre d’excellence InoVAND regroupe plus d’une trentaine d’équipes cliniques et scientifiques, mais aussi des associations.Il est piloté par le service de psychiatrie de l’enfant et de l’adolescent composé d’1 Chef de service, 12 PH, 2 CCA, 9 internes, ainsi que du personnel non médical (psychologues, orthophonistes, IDE, Logisticien, …).L’objectif du centre InoVAND est de promouvoir la recherche et la clinique pour offrir des soins d’excellence en partenariat avec un réseau d’associations.Hôpital universitaire Robert Debré48 bld SérurierMétro 11 Porte des Lilas, 7bis Près Saint GervaisCDD, possibilité de CDI à termeDuréeDurée de 6 mois, renouvelableRémunérationStatut ingénieur de recherche, échelon négociableDocuments pour candidaterCV, lettre de motivation, 2 lettres de recommandation ou coordonnées de 2 personnes référentesProcédure : CV, lettre de motivation, 2 lettres de recommandation ou coordonnées de 2 personnes référentesOffre publiée le 3 juillet 2024, affichage jusqu'au 1 septembre 2024 #J-18808-Ljbffr