H/F Ingénieur-e biologiste en écologie aquatique

Portail > Offres > Offre UMR6553-CHRPIS-006 - H/F Ingénieur-e biologiste en écologie aquatique H/F Ingénieur-e biologiste en écologie aquatique Date Limite Candidature : mercredi 26 juin 2024 23:59:00 heure de Paris Assurez-vous que votre profil candidat soit correctement renseigné avant de postuler Informations généralesIntitulé de l'offre : H/F Ingénieur-e biologiste en écologie aquatique Référence : UMR6553-CHRPIS-006Nombre de Postes : 1Lieu de travail : RENNES Date de publication : mercredi 5 juin 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 11 moisDate d'embauche prévue : 1 septembre 2024Quotité de travail : Temps complet Rémunération : entre 2850 et 3000 bruts mensuels selon expérience Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat) Expérience souhaitée : Indifférent BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnementEmploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données Missions L'objectif principal du poste est d'étudier les interactions prédateurs–proies entre les araignées et les insectes dans les agroécosystèmes de l’Ouest de la France. Puisque les insectes aquatiques sont généralement les premiers insectes à émerger, nous cherchons à déterminer si les insectes aquatiques représentent des proies alternatives pour les araignées lorsque les autres proies potentielles (i.e. les ravageurs de cultures) ne sont pas encore présentes dans l'environnement. Afin d'étudier ces interactions araignées – insectes, nous souhaitons utiliser des techniques de séquençages haut-débit de type metabarcoding sur les contenus stomacaux des araignées en nous basant sur des outils récemment développés (Lafage et al. 2019).La personne recrutée sera donc chargée d'identifier ces interactions proies – prédateur par metabarcoding. Le poste aura pour but de mettre en œuvre les différentes étapes du metabarcoding, de l'extraction d'ADN jusqu'au traitement bioinformatique des séquences et aux analyses statistiques des données. Le metabarcoding (Illumina MiSeq) sera effectué sur la plateforme de séquençage haut-débit ECOGENO de l’OSUR. Activités - Extraction d’ADN et traitement bioinformatique des séquences par metabarcoding (Illumina MiSeq)- Gestion des données moléculaires- Analyses statistiques des données- Valorisation des données (colloques, publications) Compétences - Expertise indispensable en traitement bioinformatique des données de séquençage haut-débit- Très bonnes compétences de laboratoire en biologie moléculaire (extraction d'ADN, PCR, préparation des libraires)- Très bonnes connaissances en analyses statistiques en écologie- Très bonnes capacités à valoriser les données, particulièrement en vue de publier dans des revues scientifiques à comité de lecture- Très bonnes connaissances en écologie aquatique et sur les invertébrés.- Capacité à travailler en équipe dans un contexte pluridisciplinaire et pluri-compétences- Autonomie, rigueur et force de proposition Contexte de travail Le biocontrôle est une alternative pertinente à l’utilisation de produits chimiques en agriculture. Ce service écosystémique est rendu par les communautés d’ennemis naturels des ravageurs des cultures (ex. araignées, carabes). Dans ce contexte, le rôle des insectes aquatiques dans le service écosystémique de contrôle des ravageurs est actuellement méconnu. Le rôle direct des insectes aquatiques adultes dans le contrôle biologique des ravageurs semble se limiter aux Odonates. En revanche, il existe peu de preuves du rôle indirect de ces insectes aquatiques. Ces organismes pourraient en effet service de ressources pour les agents de lutte biologique terrestres, notamment les araignées et les carabes. D’une part, ces insectes aquatiques peuvent détourner l’attention des ennemis naturels terrestres des ravageurs et ainsi perturber les services de lutte biologique. D’autre part, les invertébrés aquatiques émergent massivement au début du printemps, lorsque l’abondance des invertébrés terrestres est presque à son plus bas niveau dans les régions tempérées. Ils fournissent des acides gras oméga-3 hautement insaturés sur le plan nutritionnel par rapport aux insectes terrestres. Par conséquent, les insectes aquatiques pourraient être essentiels au maintien des populations d’ennemis naturels terrestres car ils constituent potentiellement une ressource alimentaire alternative aux ennemis naturels terrestres agents lorsque les ravageurs des cultures sont rares ou absents en début de printemps.L’hypothèse testée serait que les agents de lutte biologique terrestre se nourrissent des proies d’origine aquatique dans les habitats riverains en début de saison avant de s’attaquer aux ravageurs des cultures plus tard au printemps ou en été par un processus de débordement saisonnier des prédateurs entre les écosystèmes adjacents. Actuellement, le rôle des proies aquatiques dans le régime alimentaire des ennemis naturels terrestres reste à explorer et les conséquences possibles sur le contrôle biologique - qu'il s'agisse d’un service ou d’un disservice écosystémique – doivent être déterminées. #J-18808-Ljbffr